工程预算由于工程建设涉及面广和其本身所具有的复杂性，在其建设过程中，不可避免地发生设计变更、材料设备变更等多种引起工程预算变化的情况。对于采取中标价从签证作为结算方式的工程，更应注意增减费用的审查。应注意设计变更的审查。设计变更单是设计单位在施工中发现需要变更的部位，或是由于建设单位需要改变使用功能、装修标准等而发出的变更通知单。它应是由设计单位、建设单位、施工单位、监理单位协商后共用签署的。审查设计变更时，一要应查验手续是否完备；二要判定该项变更是否引起经济利益上的增减变动，因为有的变更只是技术变更，并不引起经济变更。还要注意查阅竣工图，因为对于工程量增加而引起费用增加的项目。
施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
本溪工程预算控制包括投资决策阶段、设计阶段、建设项目发包阶段和建设实施阶段四个阶段。建设工程项目具有施工周期长、涉及范围广、施工地点不固定、占用资金量大、施工机械设备多等特点。同时，建设工程项目的工程质量、工程进度和本溪工程预算之间有着直接的关系，三者既相互统一，又相互制约和矛盾。因此，对于整个建设工程项目来说控制其本溪工程预算极其重要。当前我国的建设程度基本上包括四个阶段，各阶段特点具体如下：目前，我国的建设程序基本上是投资决策阶段，工程设计阶段，工程实施阶段，竣工验收阶段。项目的前期阶段即为建设项目施工前各阶段的总称。①投资决策阶段需要编制初步投资估算，做可行性研究报告，由于该阶段是属于投资估算阶段，所以与终项目结算价格会存在较大差别，该阶段造价控制重点是保证投资资源充足。②在设计阶段，在不影响结构合理设计的前提下，设计单位应根据业主建设单位的设计委托书合理控制预算。③在施工工程实施阶段，以合同价为基础，按照承包方实际完成的工程量拨付工程款，同时还应该考虑到由于各种因素可能会引起的工程费用上涨，比如物价上涨等，合理确定结算价。④在竣工验收阶段，将整个工程建设过程中的各项费用进行汇集，编制竣工决算。
由于本溪工程预算招投标的不规范操作，致使本溪工程预算中标工程的价格一般较低，致使市政本溪工程预算的资金投入严重不足，为了确保本溪工程预算的施工质量，本溪工程预算的效益。市政施工部门就要进行严格的造价成本消耗监控。界定执行预算定额，注重本溪工程预算施工工序的有序衔接。以本溪工程预算预算定额为基础进行本溪工程预算的成本控制，减少本溪工程预算的造价成本消耗。通过施工组织计划的制定以及施工监理部门的设置科学的进行施工计划的调整。严格的对施工合同进行管理可以有效的避免索赔现象的发生，稳定施工秩序。施工合同管理的重点在于对市政造价工程进行严格的控制。避免施工单位以低价中标事后通过索赔提高施工效益现象的发生。市政本溪工程预算管理人员要事先做好本溪工程预算施工的把关工作，仔细分析各项施工变更给本溪工程预算施工造价带来的变化。本溪工程预算管理人员要严格的分析本溪工程预算变更的可行性，制定相关的科学的指标与评价体系，分析施工变更对工程的应用功能以及美观程度等方面的影响，确定施工变更的可行性，减少市政本溪工程预算过程中不必要的资金投入。对于施工材料供应商提供劣质建筑材料的行为进行及时的揭露并提出及时的索赔。主要涉及到施工材料供应商材料供应的质量以及时间等问题造成的工期延误甚至是本溪工程预算停滞的现象，这时施工单位就要提出相应的补偿。